MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Glaciecola sp. 4H-3-7+YE-5 chromosome

Total Repeats: 79439

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015497	GCA	2	6	127	132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332304387
2	NC_015497	TGG	2	6	156	161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332304387
3	NC_015497	GAA	2	6	167	172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332304387
4	NC_015497	GCG	2	6	174	179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332304387
5	NC_015497	TTGT	2	8	254	261	0 %	75 %	25 %	0 %	332304387
6	NC_015497	ATG	2	6	276	281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332304387
7	NC_015497	ACA	2	6	328	333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332304387
8	NC_015497	GC	3	6	416	421	0 %	0 %	50 %	50 %	332304387
9	NC_015497	AGT	2	6	422	427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332304387
10	NC_015497	CGCAT	2	10	478	487	20 %	20 %	20 %	40 %	332304387
11	NC_015497	TTTA	3	12	604	615	25 %	75 %	0 %	0 %	332304387
12	NC_015497	TGG	2	6	616	621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332304387
13	NC_015497	TTG	2	6	644	649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332304387
14	NC_015497	ATT	2	6	668	673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332304387
15	NC_015497	ATG	2	6	684	689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332304387
16	NC_015497	AAT	2	6	749	754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332304387
17	NC_015497	GAA	2	6	761	766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332304387
18	NC_015497	GAT	2	6	806	811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332304387
19	NC_015497	TTC	2	6	818	823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332304387
20	NC_015497	CAA	2	6	826	831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332304387
21	NC_015497	AAG	2	6	843	848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332304387
22	NC_015497	T	6	6	851	856	0 %	100 %	0 %	0 %	332304387
23	NC_015497	CAAC	2	8	883	890	50 %	0 %	0 %	50 %	332304387
24	NC_015497	ACC	2	6	988	993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332304387
25	NC_015497	AAAAT	2	10	1038	1047	80 %	20 %	0 %	0 %	332304387
26	NC_015497	TGA	2	6	1057	1062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332304387
27	NC_015497	T	6	6	1070	1075	0 %	100 %	0 %	0 %	332304387
28	NC_015497	TGCAAA	2	12	1135	1146	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332304387
29	NC_015497	GTC	2	6	1155	1160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332304387
30	NC_015497	TCGT	2	8	1176	1183	0 %	50 %	25 %	25 %	332304387
31	NC_015497	ATA	2	6	1233	1238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332304387
32	NC_015497	CGTAG	2	10	1304	1313	20 %	20 %	40 %	20 %	332304387
33	NC_015497	GGT	2	6	1391	1396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332304387
34	NC_015497	AGAGA	2	10	1445	1454	60 %	0 %	40 %	0 %	332304387
35	NC_015497	AGA	2	6	1468	1473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332304387
36	NC_015497	T	6	6	1552	1557	0 %	100 %	0 %	0 %	332304388
37	NC_015497	AGTT	2	8	1569	1576	25 %	50 %	25 %	0 %	332304388
38	NC_015497	AC	3	6	1597	1602	50 %	0 %	0 %	50 %	332304388
39	NC_015497	AAGT	2	8	1632	1639	50 %	25 %	25 %	0 %	332304388
40	NC_015497	AGA	2	6	1714	1719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332304388
41	NC_015497	AAG	2	6	1742	1747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332304388
42	NC_015497	ATT	2	6	1757	1762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332304388
43	NC_015497	GCA	2	6	1966	1971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332304388
44	NC_015497	TTA	2	6	1981	1986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332304388
45	NC_015497	TTA	2	6	2106	2111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332304388
46	NC_015497	GGTT	2	8	2179	2186	0 %	50 %	50 %	0 %	332304388
47	NC_015497	T	6	6	2202	2207	0 %	100 %	0 %	0 %	332304388
48	NC_015497	AGTT	2	8	2232	2239	25 %	50 %	25 %	0 %	332304388
49	NC_015497	TCG	2	6	2260	2265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332304388
50	NC_015497	TATCT	2	10	2341	2350	20 %	60 %	0 %	20 %	332304388
51	NC_015497	TAA	2	6	2410	2415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332304388
52	NC_015497	AAG	3	9	2424	2432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332304388
53	NC_015497	GAT	2	6	2465	2470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332304388
54	NC_015497	CTTAT	2	10	2493	2502	20 %	60 %	0 %	20 %	332304388
55	NC_015497	GAA	2	6	2528	2533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332304388
56	NC_015497	TGA	2	6	2587	2592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332304388
57	NC_015497	TAT	2	6	2648	2653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332304389
58	NC_015497	CAAACA	2	12	2816	2827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332304389
59	NC_015497	T	6	6	2860	2865	0 %	100 %	0 %	0 %	332304389
60	NC_015497	TTAG	2	8	2973	2980	25 %	50 %	25 %	0 %	332304389
61	NC_015497	ACA	2	6	3130	3135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332304389
62	NC_015497	AT	3	6	3183	3188	50 %	50 %	0 %	0 %	332304389
63	NC_015497	CTCA	2	8	3222	3229	25 %	25 %	0 %	50 %	332304389
64	NC_015497	ATG	2	6	3243	3248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332304389
65	NC_015497	T	6	6	3287	3292	0 %	100 %	0 %	0 %	332304389
66	NC_015497	TAT	2	6	3318	3323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332304389
67	NC_015497	AGAT	2	8	3436	3443	50 %	25 %	25 %	0 %	332304389
68	NC_015497	CTA	2	6	3511	3516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332304389
69	NC_015497	TTA	2	6	3558	3563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332304389
70	NC_015497	GAT	2	6	3564	3569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332304389
71	NC_015497	GCA	2	6	3588	3593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332304389
72	NC_015497	CTT	2	6	3618	3623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332304389
73	NC_015497	AC	3	6	3631	3636	50 %	0 %	0 %	50 %	332304389
74	NC_015497	A	7	7	3696	3702	100 %	0 %	0 %	0 %	332304389
75	NC_015497	GA	3	6	3728	3733	50 %	0 %	50 %	0 %	332304389
76	NC_015497	AGA	2	6	3753	3758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332304390
77	NC_015497	TCG	2	6	3772	3777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332304390
78	NC_015497	CAT	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332304390
79	NC_015497	TGA	2	6	3897	3902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332304390
80	NC_015497	ACGG	2	8	3946	3953	25 %	0 %	50 %	25 %	332304390
81	NC_015497	GAT	2	6	3970	3975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332304390
82	NC_015497	GAA	3	9	4003	4011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332304390
83	NC_015497	GCA	2	6	4021	4026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332304390
84	NC_015497	TCA	2	6	4031	4036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332304390
85	NC_015497	TTC	2	6	4043	4048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332304390
86	NC_015497	TGA	2	6	4065	4070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332304390
87	NC_015497	GGT	2	6	4090	4095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332304390
88	NC_015497	GAA	2	6	4270	4275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332304390
89	NC_015497	TAT	2	6	4356	4361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332304390
90	NC_015497	TATG	2	8	4398	4405	25 %	50 %	25 %	0 %	332304390
91	NC_015497	GGT	2	6	4408	4413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332304390
92	NC_015497	TCA	2	6	4458	4463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332304390
93	NC_015497	TGA	2	6	4491	4496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332304390
94	NC_015497	ATTC	2	8	4532	4539	25 %	50 %	0 %	25 %	332304390
95	NC_015497	AAT	2	6	4564	4569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332304390
96	NC_015497	G	6	6	4585	4590	0 %	0 %	100 %	0 %	332304390
97	NC_015497	GTG	2	6	4610	4615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332304390
98	NC_015497	AAG	2	6	4649	4654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332304390
99	NC_015497	CCAGCG	2	12	4676	4687	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	332304390
100	NC_015497	GAC	2	6	4690	4695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332304390
101	NC_015497	TGT	2	6	4716	4721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332304390
102	NC_015497	TTCTC	2	10	4747	4756	0 %	60 %	0 %	40 %	332304390
103	NC_015497	ATT	2	6	4864	4869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332304390
104	NC_015497	AATAA	2	10	4870	4879	80 %	20 %	0 %	0 %	332304390
105	NC_015497	GCA	2	6	4885	4890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332304390
106	NC_015497	TA	3	6	5014	5019	50 %	50 %	0 %	0 %	332304390
107	NC_015497	CTG	2	6	5033	5038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332304390
108	NC_015497	A	6	6	5067	5072	100 %	0 %	0 %	0 %	332304390
109	NC_015497	TGT	2	6	5135	5140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332304390
110	NC_015497	AAG	2	6	5147	5152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332304390
111	NC_015497	TGA	2	6	5193	5198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332304390
112	NC_015497	TAT	3	9	5229	5237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332304390
113	NC_015497	ATT	2	6	5314	5319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332304390
114	NC_015497	CTATAT	2	12	5328	5339	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332304390
115	NC_015497	GAC	3	9	5395	5403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332304390
116	NC_015497	TGAA	2	8	5456	5463	50 %	25 %	25 %	0 %	332304390
117	NC_015497	AAT	2	6	5725	5730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332304390
118	NC_015497	TAC	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332304390
119	NC_015497	TTA	2	6	5744	5749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332304390
120	NC_015497	AATC	2	8	5801	5808	50 %	25 %	0 %	25 %	332304390
121	NC_015497	GGT	2	6	5863	5868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332304390
122	NC_015497	ACA	2	6	6010	6015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332304390
123	NC_015497	CGT	2	6	6031	6036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332304390
124	NC_015497	AGA	2	6	6054	6059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332304390
125	NC_015497	GCA	2	6	6067	6072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332304390
126	NC_015497	AAG	2	6	6507	6512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332304391
127	NC_015497	ATC	2	6	6516	6521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332304391
128	NC_015497	CGTAG	2	10	6557	6566	20 %	20 %	40 %	20 %	332304391
129	NC_015497	GCA	2	6	6589	6594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332304391
130	NC_015497	TTA	2	6	6671	6676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332304391
131	NC_015497	CAG	2	6	6759	6764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332304391
132	NC_015497	AT	3	6	6783	6788	50 %	50 %	0 %	0 %	332304391
133	NC_015497	CG	3	6	6789	6794	0 %	0 %	50 %	50 %	332304391
134	NC_015497	TAA	2	6	6853	6858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332304391
135	NC_015497	TTA	2	6	6873	6878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332304391
136	NC_015497	ATT	2	6	6914	6919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332304391
137	NC_015497	GAAA	2	8	6960	6967	75 %	0 %	25 %	0 %	332304391
138	NC_015497	CAT	2	6	6976	6981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332304391
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143	NC_015497	TAC	2	6	7297	7302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332304392
144	NC_015497	TCG	2	6	7428	7433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332304392
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146	NC_015497	CAT	2	6	7519	7524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332304392
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148	NC_015497	GT	3	6	7655	7660	0 %	50 %	50 %	0 %	332304392
149	NC_015497	CATA	2	8	7723	7730	50 %	25 %	0 %	25 %	332304392
150	NC_015497	AGA	2	6	7760	7765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332304392
151	NC_015497	TCGC	2	8	7780	7787	0 %	25 %	25 %	50 %	332304392
152	NC_015497	ATTT	2	8	7822	7829	25 %	75 %	0 %	0 %	332304392
153	NC_015497	GACA	2	8	7845	7852	50 %	0 %	25 %	25 %	332304392
154	NC_015497	ATAG	2	8	7863	7870	50 %	25 %	25 %	0 %	332304392
155	NC_015497	TGA	2	6	7900	7905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332304392
156	NC_015497	AAAT	2	8	7934	7941	75 %	25 %	0 %	0 %	332304392
157	NC_015497	CT	3	6	8073	8078	0 %	50 %	0 %	50 %	332304392
158	NC_015497	T	7	7	8089	8095	0 %	100 %	0 %	0 %	332304392
159	NC_015497	TGAG	2	8	8244	8251	25 %	25 %	50 %	0 %	332304392
160	NC_015497	TAA	2	6	8270	8275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332304392
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162	NC_015497	TTG	2	6	8354	8359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332304392
163	NC_015497	TGGA	2	8	8387	8394	25 %	25 %	50 %	0 %	332304392
164	NC_015497	TTA	2	6	8460	8465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332304392
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167	NC_015497	TTG	2	6	8614	8619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332304392
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171	NC_015497	TAAG	2	8	9249	9256	50 %	25 %	25 %	0 %	332304393
172	NC_015497	CTG	3	9	9338	9346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332304394
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177	NC_015497	TAC	2	6	9619	9624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332304394
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179	NC_015497	CAAGG	2	10	9677	9686	40 %	0 %	40 %	20 %	332304394
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240	NC_015497	GACT	2	8	12770	12777	25 %	25 %	25 %	25 %	332304396
241	NC_015497	GTAG	2	8	12912	12919	25 %	25 %	50 %	0 %	332304396
242	NC_015497	CGGT	2	8	12946	12953	0 %	25 %	50 %	25 %	332304396
243	NC_015497	TAC	2	6	12968	12973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332304396
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248	NC_015497	T	7	7	13354	13360	0 %	100 %	0 %	0 %	332304397
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250	NC_015497	TACT	2	8	13468	13475	25 %	50 %	0 %	25 %	332304398
251	NC_015497	TCATCT	2	12	13553	13564	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332304398
252	NC_015497	TCA	2	6	13760	13765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332304398
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255	NC_015497	TTG	2	6	13889	13894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332304398
256	NC_015497	GCTG	2	8	13903	13910	0 %	25 %	50 %	25 %	332304398
257	NC_015497	CTT	2	6	13972	13977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332304398
258	NC_015497	T	6	6	13976	13981	0 %	100 %	0 %	0 %	332304398
259	NC_015497	TAA	2	6	14471	14476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332304399
260	NC_015497	GGTC	2	8	14514	14521	0 %	25 %	50 %	25 %	332304399
261	NC_015497	CAT	2	6	14542	14547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332304399
262	NC_015497	CT	3	6	14565	14570	0 %	50 %	0 %	50 %	332304399
263	NC_015497	TAAG	2	8	14602	14609	50 %	25 %	25 %	0 %	332304399
264	NC_015497	CAC	3	9	14709	14717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332304399
265	NC_015497	GCT	2	6	14792	14797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332304399
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380	NC_015497	CCA	2	6	23154	23159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332304405
381	NC_015497	ACC	2	6	23240	23245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332304405
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384	NC_015497	TTCCA	2	10	23333	23342	20 %	40 %	0 %	40 %	332304405
385	NC_015497	TTGA	2	8	23352	23359	25 %	50 %	25 %	0 %	332304405
386	NC_015497	AACC	2	8	23364	23371	50 %	0 %	0 %	50 %	332304405
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389	NC_015497	T	6	6	23429	23434	0 %	100 %	0 %	0 %	332304405
390	NC_015497	TAA	2	6	23579	23584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332304406
391	NC_015497	CTT	2	6	23586	23591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332304406
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